FFPE肿瘤组织DNA检测服务

用于个人化癌症管理的FFPE肿瘤组织DNA次世代定序分析

东莞上元生物科技提供一项ISO15189医学实验室服务,给需要研究福马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤组织的DNA分子特征现象的医生与临床研究员。我们的能力来自具备FFPE组织的DNA提取全自动平台、基于PCR的标的多工富集技术、样本制备、次世代定序以及基因突变分析技术的支援。此一强大工作流程可提高分析的可追溯性和可重复性,并加强了癌症突变研究的质量与功效。在个人化医疗的新时代中,针对可操作突变的序列进行定序,对癌症诊断、预后、治疗或是监测均具有重要的意义。

样本需求


  • 人类组织切片:取自10%福马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织块的3份未染色,带正电荷的连续切片。组织固定以6-48小时内的时间为佳。组织切片厚度建议为4 - 5微米。必须在制备后6周内测定组织切片。
  • 运输:组织切片于室温下运输。


DNA提取,文库制备,次世代定序和基因突变分析


  • DNA提取:从FFPE组织中提取基因组DNA,然后进行DNA纯化和定量。
  • 文库制备:将基因组DNA的片段和尺寸化后转换为双链DNA,富集基于PCR的标的物、累积扩增子(amplicon)进行样本库制备。
  • 文库制备:将基因组DNA的片段和尺寸化后转换为双链DNA,再连接寡核苷酸衔接子,并定量样本库的产物。
  • 次世代定序:根据已选的基因,进行癌症突变的靶向测序。
  • 基因突变分析:利用已发表的文献和公共数据库对癌症基因突变进一步注释与比较。


分析方法


  • 次世代定序


报告交付(10个工作天内)


提供一份癌症基因突变的解释报告。

  • 用于辨识癌症基因突变的基因
  • 利用次世代定序所得到的癌症基因突变的基因序列以及基因不同变异中的基因序列
  • 对癌症突变的注释以及其与已知数据的比较
  • 按客户的要求所进行另外的突变基因定序


服务项目/内容


癌症基因 癌症基因与变异 费用
与肿瘤有关的可操作基因项目 V2 ALK
BRAF
EGFR
ERBB2
ERBB3
ESR1
KIT
KRAS
NRAS
PDGFRA
PIK3CA
RAF1
请洽询
与肿瘤有关的可操作基因项目 V3 AKT1
ALK
BRAF
CTNNB1
DDR2
EGFR
ERBB2
ERBB3
ERBB4
ESR1
FBXW7
FGFR1
FGFR2
FGFR3
FLT3
GNA11
GNAQ
HRAS
KIT
KRAS
MAP2K1
MAP2K2
MET
NOTCH1
NRAS
PDGFRA
PIK3CA
RAF1
SMAD4
STK11
请洽询
客制化的与肿瘤相关基因项目 依照客户要求 请洽询

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