組織FFPE腫瘤DNA服務

用於個人化癌症管理的FFPE腫瘤組織DNA次世代定序分析

東莞上元生物科技提供一項ISO15189醫學實驗室服務,給需要研究福馬林固定石蠟包埋(FFPE)腫瘤組織的DNA分子特徵現象的醫生與臨床研究員。我們的能力來自具備FFPE組織的DNA萃取全自動平台、基於PCR的標的多工富集技術、樣本製備、次世代定序以及基因突變分析技術的支援。此一強大工作流程可提高分析的可追溯性和可重複性,並加強了癌症突變研究的質量與功效。在個人化醫療的新時代中,針對可操作突變的序列進行定序,對癌症診斷、預後、治療或是監測均具有重要的意義。

樣本需求


  • 人類組織切片:取自10%福馬林固定、石蠟包埋(FFPE)組織塊的3份未染色,帶正電荷的連續切片。組織固定以6-48小時內的時間為佳。組織切片厚度建議為4 - 5微米。必須在製備後6週內測定組織切片。
  • 運輸:組織切片於室溫下運輸


DNA萃取,樣本庫製備,次世代定序和基因突變分析


  • DNA萃取:從FFPE組織中提取基因組DNA,然後進行DNA純化和定量。
  • 樣本庫製備:將基因組DNA的片段和尺寸化後轉換為雙鏈DNA,富集基於PCR的標的物、累積擴增子(amplicon)進行樣本庫製備。
  • 樣本庫製備:將基因組DNA的片段和尺寸化後轉換為雙鏈DNA,再連接寡核苷酸銜接子,並定量樣本庫的產物。
  • 次世代定序:根據已選的基因選組,進行癌症突變的靶向測序。
  • 基因突變分析:利用已發表的文獻和公共數據庫對癌症基因突變進一步註釋與比較。


分析方法


  • 次世代定序


報告交付(10個工作天內)


提供一份癌症基因突變的解釋報告。

  • 用於辨識癌症基因突變的目標基因
  • 利用次世代定序所得到的癌症基因突變的基因序列以及不同變異中的基因序列
  • 對癌症突變的註釋以及其與已知數據的比較
  • 按客戶的要求所進行另外的突變基因定序


服務項目/內容


癌症基因 癌症基因與變異 費用
與腫瘤有關的可操作基因 V2 ALK
BRAF
EGFR
ERBB2
ERBB3
ESR1
KIT
KRAS
NRAS
PDGFRA
PIK3CA
RAF1
請洽詢
與腫瘤有關的可操作基因 V3 AKT1
ALK
BRAF
CTNNB1
DDR2
EGFR
ERBB2
ERBB3
ERBB4
ESR1
FBXW7
FGFR1
FGFR2
FGFR3
FLT3
GNA11
GNAQ
HRAS
KIT
KRAS
MAP2K1
MAP2K2
MET
NOTCH1
NRAS
PDGFRA
PIK3CA
RAF1
SMAD4
STK11
請洽詢
客製化的與腫瘤相關基因 依照客戶要求 請洽詢

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